Перечень международных организаций, в отношении которых применяется положение пп. 11 п. 1 ст. 164 НК РФ, утвержден Приказом МИД России и Минфина России от 24.03.2014 № 3913/19н.
Правила применения налоговой ставки 0% по НДС при реализации товаров (работ, услуг) для официального использования международными организациями и их представительствами, осуществляющими деятельность на территории Российской Федерации, утверждены Постановлением Правительства РФ от 22.07.2006 № 455 (далее – Правила).
Порядок рассмотрения и возврата НДС установлен положениями п. 7 и 8 Правил, согласно которым налоговый орган в течение 3 месяцев со дня поступления заявления о возмещении налога рассматривает представленные документы и принимает мотивированное решение о полном или частичном возврате НДС или об отказе в его возврате. Возврат НДС международной организации производится путем перечисления соответствующих сумм налога на счета, указанные в заявлении, открытые международной организации в уполномоченных банках, зарегистрированных на территории Российской Федерации.